تعد صحة الأمهات والمواليد من أهم قضايا الصحة العامة في جيبوتي. لذلك، حدد البلد أهدافًا رئيسية لتقليص معدل وفيات الأمهات إلى 90/100,000 ومعدل وفيات المواليد إلى 25/1000 بحلول عام 2020، وذلك في "خطة العمل الوطنية لمكافحة وفيات الأمهات". ويهدف هذا المشروع إلى الحد من أمراض ووفيات الأمهات والأطفال، بتحسين حصول الأمهات والأطفال والمواليد على خدمات رعاية صحية جيدة، وتعزيز استخدام تلك الخدمات في جيبوتي. ويتضمن المشروع توفير المعدات الطبية اللازمة، وبناء قدرات العاملين في قطاع الصحة وعامة الجمهور من خلال التدريب والتعبئة الاجتماعية.